El tratamiento quirúrgico de la craneosinostosis comenzó en 1890 y múltiples procedimientos se han desarrollado y promovido para el tratamiento de esta condición. Actualmente, la corrección quirúrgica de la craneosinostosis, la realizan equipos de médicos especialistas en cirugía craneofacial, que practican una variedad de procedimientos los cuales con frecuencia tiene como resultado la corrección exitosa de las deformidades derivadas de esta enfermedad.

La cirugía "tradicional" se lleva a cabo realizando una incisión en el cuero cabelludo de oreja a oreja, moviendo el cuero cabelludo dejando expuesto el cráneo, se realiza un retiro total o parcial del cráneo, seguido de una corrección o reemplazo del cráneo con una variedad de materiales.

Por lo general, la cirugía lleva muchas horas (de 3 a 7), para la mayoría de éstas se necesita transfusión de sangre y hospitalización por tres o cinco días. Con frecuencia, se observa excesiva hinchazón postoperatoria y puede estar relacionada con cierto dolor e incomodidad.